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m6A修饰对A-to-I编辑的负向调控作用及其机制

时间:2020-12-15 22:41来源:未知 作者:admin 点击:

迄今为止,多达100多种的RNA修饰已在体内被发现,其中m6A修饰及A-to-I编辑是存在于(m)RNA上最普遍的两种RNA水平的表观修饰,且均发生于腺苷(adenosine, A)上。这两种A上的RNA表观修饰在催化原理和发生位置上存在很大不同:m6A主要由甲基化酶复合体(METTL3和METTL14)催化发生,并由去甲基化酶(FTO和ALKBH5)可逆调节去甲基,其主要发生在单链RNA的A碱基上;而A-to-I编辑主要由ADAR酶介导,其主要发生在位于双链RNA的A碱基上,尚没有可逆的编辑酶被发现。因此,基于它们在催化原理和发生位置上的差异,推断m6A和A-to-I这两种最普遍的RNA表观修饰一般来讲不会竞争在同一个A碱基位置发生。但它们之间是否存在其它的互作关系,尚不清楚。


  在该工作中,研究人员利用计算和实验相结合的系统研究方法,对m6A阳性和m6A阴性的RNA-seq数据进行A-to-I编辑的比较分析,揭示m6A修饰与A-to-I编辑之间存在一定的负相关关系;通过分析m6A甲基化酶METTL3和/或METTL14敲除样本中的A-to-I编辑进一步揭示m6A修饰对A-to-I编辑的负向调控作用;通过对多个内源转录本和构建的报告质粒在正常条件和METTL3/METTL14双敲条件下进行比较分析,发现ADAR1与m6A阳性转录本的结合能力较弱,而在METTL3/METTL14双敲抑制m6A时,ADAR1与m6A阴性转录本的结合能力则显著提高,这提示m6A修饰对A-to-I编辑的负向调控作用可能是通过调节其与ADAR1的结合能力而实现。


  研究工作得到了国家基金委、科技部、中科院及HHMI基金会的支持。研究揭示了A-to-I编辑在不同转录组中的动态变化调控以及A-to-I编辑酶ADAR在miRNA成熟过程中的全新作用,而这项最新的不同RNA修饰之间的互作研究为全面揭示复杂RNA表观修饰调控提供了新思路和新基础。